Kurikulum yang digunakan Pondok Pesantren Al Faruq As Salafy Li Tahfizhil Quran Purwokerto meliputi Bidang Aqidah, Bidang Al-Quran dan Ulumul Quran, Bidang Fiqih dan Ushul Fiqih, Bidang Hadits dan Ushul Hadits, Bidang Lughotul Arobiyah serta dibekali dengan ilmu-ilmu umum seperti: Bahasa Indonesia, Matematika, Ilmu Pengetahuan Alam, Keterampilan dan lain-lain. Adapun bidang disiplin ilmu dan kitab yang dipakai adalah sebagai berikut:

Bidang Aqidah

  • Kitab Tajridut Tauhid Al-Mufid,  karya : Imam Taqiyyuddin Ahmad bin ‘Ali Al-Maqrizi asy-Syafi’i
  • Kitab Ushulus Sunah karya al-Imam Ahmad bin Hanbal.
  • Aqidah Qoirowaniyyah karya Abu Muhammad ‘Abdullah bin Abi Zaid ‘Abdurrahman An-Naghrawi Al-Qairawani al-Maliki

Bidang Al-Quran dan Ulumul Quran

  • Tuhfathul Athfal (Tajwid) Karya Syaikh Sulaiman bin Hasan bin Muhammad Al Jamzuriy.
  • al-Muqaddimah al-Jazariyyah (Tajwid)  Karya al-Imam Muhammad bin Muhammad bin Muhammad yang ma’ruf dengan sebutan ibnul Jazariy.
  • Tafsir al-Qur’ân al-Adzhīm (Tafsir) karya Ismail bin Umar bin Katsir al-Qursyi ad-Damasyqi (Ibnu Katsir)

Bidang Fiqih dan Ushul Fiqih

  • Kifayatul akhyar fii alli ghaayatil ikhtishaar, Karya al-Imam Taqiyuddin Abu Bakr bin Muhammad al-Husaini al-Hisni ad-Dimasyi asy-Syafii
  • Bulugh al-Maram min Adillat al-Ahkam, karya al-Hafizh Ibnu Hajar Al-Asqalani
  • Al-Ushul min ‘Ilmil Ushul karya Muhammad bin Shalih al-Utsaimin

Bidang Hadits dan Ulumul Hadits

  • Arbaîn Nawawiyah karya Imam Abu Zakariya Muhyiddin bin Syaraf An-Nawawi.
  • At-tibyan fi Adabi Hamalatil-Quran, karya Abi Zakariya Yahya bin Syarafuddin an-Nawawi.
  • Shahih Bukhori Karya Imam Bukhari
  • Shohih Muslim Karya Imam Muslim
  • Riyadus Shalihin karya Imam Abu Zakariya Muhyiddin bin Syaraf An-Nawawi

Bidang Lughotul Arobiyah

  • Al-Ajrumiyah karya Abu Abdullah Muhammad Ash-Shinhaji Ibnu Ajurrum.
  • Mutammimah Al-Jurumiyyah fi Ilmil Arabiyyah Karya Syamsuddin Muhammad bin Muhammad bin Abdurrahman bin Husain Ar Rainy.
  • Alfiyah Ibnu Malik karya Jamaluddin Abi Abdillah bin Malik Asy-Syafi’i.
  • Al-Mumti’ li Ibni ‘Ushfur; Al-Mumti’ Al-Kabir fi At-Tashrif, karya Abul Hasan Ali bin ‘Ushfur.
  • Al Arabiyah lin Nasyiin, karya Muhammad Ismail Shini, Nashif Mustafa Abdul Aziz, Mukhtar Thohir Husain
  • Durusul Lughah al-Arabiyyah karya Syaikh Prof. Dr. V. Abdurrahiim.